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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  33 lines
  1. ***********************************
  2. * GTP cyclohydrolase I signatures *
  3. ***********************************
  4.  
  5. GTP cyclohydrolase  I  (EC 3.5.4.16) catalyzes the biosynthesis of formic acid
  6. and dihydroneopterin triphosphate from GTP. This reaction is the first step in
  7. the biosynthesis of tetrahydrofolate in prokaryotes, of tetrahydrobiopterin in
  8. vertebrates, and of pteridine-containing pigments in insects.
  9.  
  10. GTP cyclohydrolase  I is a protein of from 190 to 250 amino acid residues. The
  11. comparison of the sequence of the enzyme from bacterial and eukaryotic sources
  12. shows that  the  structure  of  this  enzyme has been extremely well conserved
  13. throughout evolution [1,2].
  14.  
  15. As signature patterns we selected two conserved regions.  The first contains a
  16. perfectly conserved tetrapeptide that  could be part of the active site of the
  17. enzyme.
  18.  
  19. -Consensus pattern: [DE](2)-[LIVM](2)-x-[LIVM]-[KR]-D-[LIVM]-x(3)-S-x-C-E-H-H
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Consensus pattern: R-x-Q-[LIVM]-Q-E-R-[LIVM]-T
  24. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  25. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  26.  
  27. -Last update: October 1993 / First entry.
  28.  
  29. [ 1] Babitzke P., Gollnick P., Yanofsky C.
  30.      J. Bacteriol. 174:2059-2064(1992).
  31. [ 2] Togari A., Ichinose H., Matsumoto S., Fujita K., Nagatsu T.
  32.      Biochem. Biophys. Res. Commun. 187:359-365(1992).
  33.